A história desenrola-se em 2030. O Boy Detectives Club reúne-se sob Kogoro Akechi, o misterioso detetive. O grupo resolve casos grandes e pequenos usando as suas habilidades únicas. Um dia, um membro do clube, Kensuke Hanazaki, encontra Yoshio Kobayashi. O corpo de Kobayashi não pode morrer devido aos efeitos do “Unidentifiable Mist”, mas ele anseia por morrer e foge do contacto com outras pessoas. Interessando-se por ele, Hanazaki convida-o a juntar-se ao Boy Detectives Club.