A história gira em torno do garoto Itsuka Shido, um estudante que em um belo dia de primavera acaba envolvido em uma explosão que acontece em sua cidade. O que ele não contava é que no meio da explosão surgisse uma linda garota com uma roupa bem… inusitada. O mais estranho é que sua irmã, Kotori, parece saber tudo da garota! Ela diz que se trata de uma “Designada criatura desastrosa especial” e que Shido deve começar a “sair” com ela para salvar o mundo… Shido então, nomeia a garota de Tohka e descobre que ela foi responsável por dizimar uma parte da população a 30 anos atrás. O único jeito de parar “a criatura especial”, é saindo com ela.